Файлы-то программа наверно воспримет, только надо прописать в фитс-шапку дату наблюдений либо в обычном формате, либо просто сделать в шапке ключь JD и написать в него Юлианскую Дату. Но за качество фотометрии по снимкам сконверченым из JPG я не ручаюсь!.. 
В JPG есть шапка с указанием даты, просто у нее не FITS стандарт (но есть свой). Да и качественная фотометрия не нужна - нужен поиск новых объектов на снимке.
Вопрос: а можно проводить только поиск только транзиентов без поиска переменных? и наоборот?